Ena osnovnih nalog Sklada NEK je plemenitenje sredstev, ki se stekajo vanj. Sklad NEK sredstva, ki jih prejme od deleža električne energije, proizvedene v NEK in prodane v Sloveniji, nalaga v prvorazredne vrednostne papirje in depozite pri poslovnih bankah. Plemenitenje sredstev mora biti skladno z naložbeno politiko Sklada NEK, ki se sprejema vsako leto posebej, k njej pa mora dati svoje soglasje tudi Vlada Republike Slovenije.
Zaradi zagotavljanja varnosti naložb si Sklad NEK postavlja določene omejitve glede razpršenosti naložb, prednost imajo naložbe s stabilno rastjo, ki hkrati zagotavljajo visoko likvidnost sredstev. Temeljni merili pri odločitvi za posamezno investicijo sta njena stopnja donosa in pričakovana varnost investicije. Od leta 2003 Sklad NEK lahko nalaga sredstva tudi v delnice investicijskih družb, točke vzajemnih skladov in strukturirane finančne produkte z zajamčenim donosom.