Nadzorni odbor, ki ga sestavljajo predsednik in devet članov, bedi nad delom Sklada NEK. Vse člane nadzornega odbora imenuje
Državni zbor RS, njihov mandat je pet let, njihova osrednja pristojnost pa je nadzor zakonitosti dela upravnega odbora in direktorja Sklada NEK.
Poleg tega nadzorni odbor:
- preverja zaključni račun in poročilo o poslovanju Sklada;
- enkrat letno poroča Državnemu zboru RS.
Člani nadzornega odbora so:
Mavec mag. Marko (predsednik), g. Engel Matjaž, Goranović mag. Sanja, g. Horvat Bojan, Props mag. Franc, mag. Sotošek Vojko, Stanko mag. Miran, ga. Stopar Brigita, Šalamun dr. Igor in ga. Šterban Bezjak Nataša.